...В 1699 году Никита Акинфов сначала был отправлен в тюрьму, но позже пострижен в монахи и отослан в Кирилло-Белозерский монастырь, где принял имя Ионникий. Всё его имущество перешло государю. По милости Петра I Акинфову было разрешено «учинить наследником, кого он хочет». Наследником монах Ионникий сделал своего внука Николая Петровича, чем вызвал недовольство дочери Анны Никитичны и её мужа Григория Дмитриевича Юсупова-Княжева. Это привело к многолетней тяжбе между родственниками. Позже Никита Акинфов пожалел о своём выборе, так как внук оказался скупым, и встал на сторону дочери, но в конце Алтуфьево всё равно закрепилась за внуком.
После смерти Николая усадьба отошла к его сыну Юрию Акинфову, который продал её в 1759 году поручику Ивану Ивановичу Вельяминову. При Вельяминове был реконструирован давно утраченный регулярный парк с двумя прудами, в 1763 году отстроена заново церковь Воздвижения Креста Господня в стиле позднего барокко, которую завершала своеобразная колокольня вместо обычного купола, а в 1767 году был заложен господский дом «в тринадцать покоев» также в барочном стиле.
Переделки продолжил следующий хозяин, которому И. Вельяминов продал имение в 1766 году за 40 тысяч рублей, князь и генерал Степан Борисович Куракин. Выйдя через три года в отставку, он занялся благоустройством Алтуфьева. При нём усадьба была дополнена новыми каменными и деревянными служебными постройками, пристроен второй деревянный этаж, разбит регулярный сад, а на речке Самотёке (Самотышке) располагались мучная мельница и два жерновых постава. В пруду плавала подсаженная рыба, караси, в речке — щука, караси, окуни, плотва. По дровяному лесу, берёзовому и осиновому, бегали звери — зайцы, лисы, волки. На территории Алтуфьева водились тетерева, куропатки, утки, кулики. Из построек в нынешнем состоянии сохранилась лишь пивоварня, построенная в стиле классицизма. В 1800 году в Алтуфьево насчитывало 20 крестьянских дворов, в которых проживали крестьяне — 141 мужчина и 142 женщины. При Куракине усадьбу посещали поэт-сентименталист Иван Дмитриев, драматург Денис Фонвизин, баснописец Иван Крылов.
XIX век стал для усадьбы настоящим испытанием. При наступлении французов на Москву в 1812 году церковь в Алтуфьево разграбили и село сильно пострадало. После комплекс вновь сменил владельца и к середине века оказался у статского советника Н. А. Жеребцова. Но случилась новая оказия — после отмены крепостного права имение поделили между хозяином и освобожденными крестьянами. Жеребцову достались дом с прудом и часть южной территории, местным жителям — все северо-восточные земли. В последующие годы имение еще неоднократно перепродавали, пока оно не досталось нефтепромышленнику Г. М. Лианозову, а затем его сыновьям. У них усадьбу купила Т. М. Унковская, которая организовала пансион для состоятельных москвичей.
...На момент 2017 года усадебный комплекс представлен господским домом, сохранившим оформление 1851 года, отреставрированной церковью Воздвижения Креста Господня 1763 года, пивоварней, конюшней и парком с прудом. На данный момент все постройки усадьбы переданы церкви для устройства благотворительных учреждений. Послушники церкви периодически проводят реставрационные работы.
Господский дом сохранил вид, полученный в 1851 году, когда Алтуфьевым владел Николай Жеребцов. В оформлении фасадов использованы элементы, характерные для средневекового русского зодчества, причём как каменного, так и деревянного: кувшинообразные колонки, кокошники и другое. Внутри в одном из помещений есть барельеф на тему отечественной истории. Фронтон дома украшен гербом Жеребцовых. Дом в Алтуфьеве на сегодняшний момент является единственным образцом усадебного господского дома в русском стиле.
